Por Resolución de Directorio Nº 833/10/2016, se creó el Comité de Auditoría de ANCAP, como órgano asistente del Directorio en el cumplimiento de sus responsabilidades relativas a la supervisión de la integridad de la información financiera; la efectividad del sistema de gobierno corporativo, control interno y gestión de riesgos; el cumplimiento de las normas éticas y legales; y el desempeño de la Auditoría Interna y de la Auditoría Externa.
Este comité está conformado actualmente por el Presidente Ing. Alejandro Stipanicic, Vicepresidente Dr. Diego Durand, Director Dr. Enrique Pées y el Gerente de Auditoría Dr. Víctor Ermida que actúa como Secretario del Comité y participa como asesor técnico en temas de su competencia, con voz y sin voto.